西元2199年來自太陽系外的敵人加米拉斯帝國(guó)為了挽救母星的危亡開始侵略其他星球地球軍在與加米拉斯帝國(guó)軍的交戰(zhàn)中慘敗同時(shí)加米拉斯帝國(guó)軍向地球發(fā)射大量含有放射能的游星炸彈地球的抵抗力量越來越弱本與加米拉斯為雙子星球的伊斯坎達(dá)爾星球仗義相助向地球發(fā)送了波動(dòng)引擎和波動(dòng)炮的設(shè)計(jì)圖紙并告知地球軍本星球擁有清除放射能的設(shè)備“宇宙清洗器D”在與歐洲、美洲失去聯(lián)系的情況下地球防衛(wèi)軍利用伊斯坎達(dá)爾星球提供的技術(shù)將沉睡于海底的大和號(hào)改造為宇宙戰(zhàn)艦大和號(hào)全體乘員踏上了取回“宇宙清洗器D”的漫漫征程